Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms