Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSP20132 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSP20132 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSP20132 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSP20132 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSP20132 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSP20132 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSP20132 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSP20132 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSP20132 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSP20132 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSP20132 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSP20132 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSP20132 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSP20132 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSP20132 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSP20132 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSP20132 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSP20132 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSP20132 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSP20132 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSP20132 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSP20132 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSP20132 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDSP20132 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDSP20132 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDSP20132 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDSP20132 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDSP20132 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDSP20132 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SDSP20132 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SDSP20132 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDSP20132 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SDSP20132 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SDSP20132 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDSP20132 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDSP20132 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDSP20132 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDSP20132 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDSP20132 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDSP20132 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDSP20132 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SDSP20132 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDSP20132 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDSP20132 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDSP20132 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDSP20132 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDSP20132 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SDSP20132 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SDSP20132 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SDSP20132 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDSP20132 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDSP20132 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDSP20132 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDSP20132 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDSP20132 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDSP20132 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDSP20132 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SDSP20132 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDSP20132 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms