Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DESP17661 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DESP17661 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DESP17661 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DESP17661 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DESP17661 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DESP17661 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DESP17661 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DESP17661 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DESP17661 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DESP17661 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DESP17661 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DESP17661 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DESP17661 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DESP17661 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DESP17661 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DESP17661 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DESP17661 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DESP17661 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DESP17661 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DESP17661 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DESP17661 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DESP17661 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DESP17661 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DESP17661 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DESP17661 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DESP17661 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DESP17661 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DESP17661 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DESP17661 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DESP17661 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DESP17661 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DESP17661 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DESP17661 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DESP17661 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DESP17661 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DESP17661 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DESP17661 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DESP17661 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DESP17661 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DESP17661 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DESP17661 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms