Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF3P17036 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms