Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB4P16144 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms