Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NME1P15531 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NME1P15531 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NME1P15531 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NME1P15531 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NME1P15531 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NME1P15531 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NME1P15531 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NME1P15531 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME1P15531 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME1P15531 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms