Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms