Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms