Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MS4A1P11836 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A1P11836 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms