Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PF4V1P10720 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PF4V1P10720 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PF4V1P10720 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PF4V1P10720 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PF4V1P10720 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PF4V1P10720 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PF4V1P10720 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PF4V1P10720 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PF4V1P10720 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PF4V1P10720 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PF4V1P10720 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PF4V1P10720 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PF4V1P10720 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PF4V1P10720 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PF4V1P10720 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PF4V1P10720 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PF4V1P10720 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PF4V1P10720 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PF4V1P10720 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PF4V1P10720 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PF4V1P10720 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms