Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2AF1L5P0DN76 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2AF1L5P0DN76 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms