Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms