Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC166P0CW27 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms