Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms