Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HSP90AB1P08238 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms