Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM2P07951 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms