Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD1O95696 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRD1O95696 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRD1O95696 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD1O95696 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD1O95696 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD1O95696 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD1O95696 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD1O95696 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD1O95696 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD1O95696 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD1O95696 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD1O95696 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD1O95696 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD1O95696 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD1O95696 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD1O95696 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD1O95696 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD1O95696 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRD1O95696 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD1O95696 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD1O95696 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD1O95696 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD1O95696 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD1O95696 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD1O95696 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD1O95696 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD1O95696 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD1O95696 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD1O95696 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD1O95696 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD1O95696 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD1O95696 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRD1O95696 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms