Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNTO95613 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNTO95613 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNTO95613 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNTO95613 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNTO95613 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNTO95613 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNTO95613 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNTO95613 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNTO95613 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNTO95613 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNTO95613 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNTO95613 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNTO95613 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNTO95613 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNTO95613 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNTO95613 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNTO95613 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNTO95613 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNTO95613 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNTO95613 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNTO95613 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNTO95613 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNTO95613 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNTO95613 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNTO95613 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNTO95613 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNTO95613 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNTO95613 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNTO95613 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNTO95613 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNTO95613 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNTO95613 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNTO95613 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNTO95613 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNTO95613 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNTO95613 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNTO95613 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNTO95613 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNTO95613 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNTO95613 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNTO95613 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms