Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms