Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD4O95243 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD4O95243 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD4O95243 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD4O95243 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD4O95243 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD4O95243 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD4O95243 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD4O95243 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD4O95243 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD4O95243 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD4O95243 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD4O95243 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD4O95243 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD4O95243 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD4O95243 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD4O95243 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD4O95243 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD4O95243 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD4O95243 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MBD4O95243 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MBD4O95243 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MBD4O95243 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD4O95243 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD4O95243 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD4O95243 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD4O95243 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD4O95243 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD4O95243 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD4O95243 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD4O95243 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD4O95243 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD4O95243 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD4O95243 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD4O95243 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD4O95243 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD4O95243 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD4O95243 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD4O95243 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD4O95243 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms