Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRATO95237 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRATO95237 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRATO95237 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRATO95237 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRATO95237 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRATO95237 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRATO95237 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRATO95237 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRATO95237 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRATO95237 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRATO95237 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRATO95237 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRATO95237 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRATO95237 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRATO95237 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRATO95237 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRATO95237 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRATO95237 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRATO95237 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRATO95237 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRATO95237 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRATO95237 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRATO95237 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRATO95237 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRATO95237 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRATO95237 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRATO95237 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms