Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPO95166 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPO95166 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPO95166 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPO95166 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPO95166 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPO95166 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPO95166 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPO95166 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPO95166 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABARAPO95166 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPO95166 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPO95166 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPO95166 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPO95166 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPO95166 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPO95166 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPO95166 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPO95166 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPO95166 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABARAPO95166 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms