Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
UPP2O95045 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
UPP2O95045 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP2O95045 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP2O95045 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP2O95045 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP2O95045 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP2O95045 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP2O95045 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP2O95045 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP2O95045 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP2O95045 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP2O95045 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP2O95045 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP2O95045 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP2O95045 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP2O95045 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP2O95045 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP2O95045 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP2O95045 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UPP2O95045 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPP2O95045 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UPP2O95045 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP2O95045 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP2O95045 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP2O95045 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP2O95045 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP2O95045 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP2O95045 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP2O95045 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP2O95045 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP2O95045 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP2O95045 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP2O95045 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP2O95045 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP2O95045 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPP2O95045 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP2O95045 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP2O95045 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP2O95045 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP2O95045 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP2O95045 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP2O95045 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP2O95045 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP2O95045 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP2O95045 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP2O95045 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP2O95045 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP2O95045 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP2O95045 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP2O95045 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP2O95045 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP2O95045 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPP2O95045 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms