Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F6O75461 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F6O75461 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F6O75461 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F6O75461 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F6O75461 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F6O75461 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F6O75461 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F6O75461 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F6O75461 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F6O75461 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F6O75461 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F6O75461 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F6O75461 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F6O75461 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F6O75461 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F6O75461 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F6O75461 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F6O75461 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F6O75461 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F6O75461 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F6O75461 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F6O75461 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms