Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPNO60542 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSPNO60542 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPNO60542 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPNO60542 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPNO60542 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPNO60542 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPNO60542 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPNO60542 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPNO60542 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPNO60542 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPNO60542 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPNO60542 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPNO60542 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPNO60542 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPNO60542 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPNO60542 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPNO60542 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPNO60542 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPNO60542 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms