Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC30■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC30■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC30■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
KIAA0556O60303 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms