Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms