Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRC1O43663 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRC1O43663 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRC1O43663 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRC1O43663 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRC1O43663 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRC1O43663 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRC1O43663 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRC1O43663 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRC1O43663 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRC1O43663 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRC1O43663 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRC1O43663 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRC1O43663 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRC1O43663 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRC1O43663 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRC1O43663 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRC1O43663 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRC1O43663 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRC1O43663 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRC1O43663 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRC1O43663 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRC1O43663 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRC1O43663 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRC1O43663 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRC1O43663 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRC1O43663 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRC1O43663 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRC1O43663 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRC1O43663 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRC1O43663 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRC1O43663 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRC1O43663 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRC1O43663 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRC1O43663 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRC1O43663 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRC1O43663 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRC1O43663 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRC1O43663 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRC1O43663 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRC1O43663 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PRC1O43663 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRC1O43663 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRC1O43663 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRC1O43663 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRC1O43663 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRC1O43663 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRC1O43663 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRC1O43663 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRC1O43663 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRC1O43663 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRC1O43663 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRC1O43663 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRC1O43663 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRC1O43663 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRC1O43663 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRC1O43663 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRC1O43663 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRC1O43663 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRC1O43663 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRC1O43663 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRC1O43663 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRC1O43663 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRC1O43663 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRC1O43663 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRC1O43663 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRC1O43663 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRC1O43663 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRC1O43663 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRC1O43663 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRC1O43663 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRC1O43663 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRC1O43663 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms