Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP2AO43633 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP2AO43633 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms