Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNPATO15228 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNPATO15228 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNPATO15228 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNPATO15228 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNPATO15228 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPATO15228 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPATO15228 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPATO15228 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPATO15228 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPATO15228 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPATO15228 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPATO15228 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPATO15228 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPATO15228 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPATO15228 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPATO15228 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPATO15228 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPATO15228 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPATO15228 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPATO15228 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPATO15228 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPATO15228 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPATO15228 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPATO15228 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPATO15228 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPATO15228 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPATO15228 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPATO15228 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPATO15228 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPATO15228 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPATO15228 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPATO15228 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPATO15228 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPATO15228 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPATO15228 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPATO15228 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPATO15228 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPATO15228 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPATO15228 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPATO15228 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPATO15228 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPATO15228 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPATO15228 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPATO15228 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPATO15228 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPATO15228 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPATO15228 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPATO15228 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPATO15228 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPATO15228 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPATO15228 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPATO15228 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPATO15228 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPATO15228 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
GNPATO15228 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPATO15228 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPATO15228 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPATO15228 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPATO15228 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPATO15228 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPATO15228 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPATO15228 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPATO15228 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPATO15228 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPATO15228 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPATO15228 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPATO15228 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPATO15228 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPATO15228 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPATO15228 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms