Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms