Protein–RNA interactions for Protein: O00110

OVOL3, Putative transcription factor ovo-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OVOL3O00110 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OVOL3O00110 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms