Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms