Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00587B1AMM8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms