Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L5A8MUK1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L5A8MUK1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms