Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC160A6NGH7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC160A6NGH7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms