Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms