Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPDC1A2A3K4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms