Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRGMA1A4Y4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms