Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCINQ13939 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCINQ13939 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCINQ13939 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCINQ13939 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCINQ13939 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCINQ13939 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCINQ13939 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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CCINQ13939 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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CCINQ13939 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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CCINQ13939 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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CCINQ13939 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCINQ13939 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCINQ13939 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCINQ13939 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCINQ13939 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCINQ13939 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCINQ13939 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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