Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASB15-206ENST00000451558 4788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ILDR2-201ENST00000271417 13140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYO10-201ENST00000274203 11456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSC1-208ENST00000545250 8310 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SVIL-202ENST00000375398 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIPA1L1-203ENST00000537413 4129 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01814-202ENST00000454224 8839 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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