Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 IL16-201ENST00000302987 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ACAD10-201ENST00000313698 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXL7-201ENST00000329673 3960 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 DDR1-AS1-206ENST00000458361 3994 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 HEATR6-201ENST00000184956 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 WSCD2-207ENST00000549903 3534 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM178B-202ENST00000565468 10558 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM178B-203ENST00000610315 10552 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 UVSSA-202ENST00000389851 12605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PCMTD2-203ENST00000308824 3843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 DPP3-215ENST00000541961 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01193-201ENST00000553416 3401 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 DPP3-205ENST00000530165 2251 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SPTB-208ENST00000556626 10153 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SORBS2-201ENST00000284776 5996 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF317-201ENST00000247956 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ATAD2-205ENST00000521903 5143 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AHI1-202ENST00000327035 3638 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02554-201ENST00000426467 5052 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TBX5-AS1-201ENST00000528549 3620 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP6-201ENST00000260376 2142 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP6-223ENST00000616176 2102 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CAPN3-201ENST00000318023 3172 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AARS2-201ENST00000244571 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 JAM2-201ENST00000312957 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR91-201ENST00000354475 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO15A-217ENST00000615845 11860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMK2G-203ENST00000322680 3818 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 GLI1-208ENST00000546141 3475 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RASGRP4-204ENST00000454404 3116 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AFF1-202ENST00000395146 9285 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 JDP2-204ENST00000437176 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004147.2-201ENST00000583224 3753 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 DPY19L4-201ENST00000414645 6197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 OTUD7B-202ENST00000581312 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PLAGL1-202ENST00000360537 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091013.1-201ENST00000499752 3734 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR11-201ENST00000263461 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PRDM9-201ENST00000296682 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP98-205ENST00000397007 3698 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TAF1-201ENST00000276072 5692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PPFIA2-227ENST00000552948 3976 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 STON2-201ENST00000267540 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 FANCA-230ENST00000568369 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SCRN1-201ENST00000242059 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NET1-202ENST00000380359 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF45-206ENST00000615985 2912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRF3-201ENST00000311519 3240 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF111-202ENST00000557998 4803 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MYH15-201ENST00000273353 7074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SKIV2L2-201ENST00000230640 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PXYLP1-207ENST00000508812 4158 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL7L1-208ENST00000493763 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA71C-201ENST00000364642 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-67P-201ENST00000384446 164 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR646-201ENST00000385067 94 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TRMT112P4-201ENST00000429016 379 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016027.3-201ENST00000429618 361 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 FTH1P27-201ENST00000449509 551 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL333P-201ENST00000476398 297 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL320P-201ENST00000484133 295 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL472P-201ENST00000492799 293 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM197Y9-203ENST00000505707 345 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.9 ms