Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA1Q9Y6Y1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms