Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms