Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF3AQ9Y496 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF3AQ9Y496 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms