Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NINLQ9Y2I6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NINLQ9Y2I6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms