Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNQ9UQP3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms