Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX6Q9UNH7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms