Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX7Q9UNH6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNX7Q9UNH6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms