Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP18Q9UMW8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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